Post on 30-Dec-2016
SILABUS MIKROBIOLOGI TANAH
I. IDENTITAS MATA KULIAH
Jurusan/PS : BiologiMata Kuliah : Mikrobiologi Tanah Kode : SKS : 3 SKS)Semester : 5Prasyarat : Mikrobiologi Umum
II. DESKRIPSI MATA KULIAH:
Mata kuliah inidiberikan pada mahasiswa untuk dapat memahami Mikroorganisme dalam tanah dan interaksinya dengan lingkungan, Metoda
umum yang digunakan dalam memisahkan dan mempelajari mikroorganisme tanah, mikroorganisme dalam tanah yang bermanfaat dalam
penggunaan sebagai pupuk hayati (Rhizobium) serta factor-faktor pembatas penggunaan legume dan proses nitrifikasi dan denitrifikasi,
pemanfaatan Streptomyces sebagai biobakterisida, jenis jenis mikoriza dan Metoda dan prinsip pengamatan mikoriza . Interaksi akar dan
bakteri dalam proses biokontrol penyakit tanaman Penguasaan pengetahuan ini akan memberi manfaat bagi pola berpikir yang melandasi
kemampuan teknis dalam bersikap dan bertindak bagi pemanfaatan bakteri yang berada di tanah.
Standar Kompetensi : Setelah menyelesaikan matakuliah ini yaitu pada akhir semester 5 mahasiswa dapat memahami dan mengusaai
pemanfaatan mikroorganisme dalam tanah bagi umat manusia.
KompetensiDasar
Indikator Pencapaian
Materi pokok Pengalaman Belajar/Kegiatan
Mhs
Alokasi
Waktu
Media/Sumber
Penilaian
1 3 4 5 6 71-5 Memahami
dan mengusaai pemanfaatan mikroorganisme dalam tanah bagi umat manusia
Mahasiswa dapat memahami dan menerangkan Mikroorganisme penghuni tanah serta pemanfaatannya sebagai pupuk hayati dan penghasil biobakterisida
Pengantar tentang mikrobiologi tanah , metoda isolasi bakteri tanah dan interaksinya dengan tanaman legume serta penggunaan sebagai pupuk dan biobakterisida
Mampu menganalisa mikroorganisme penghuni tanah yang bermanfaat bagi manusia
4x100 mnt
1. Hand out2. Buku
referensi terkait
3. Diskusi dan presentasi
1. UTS 30%2. UAS 40%3. Quiz 10%4. Presentasi
20%
6-7 Menguasai pengetahuan mikoriza dan metoda pengamatan mikoriza
Mahasiswa dapat menerangkan mikoriza, dan cara pengamatan
Pengertian jenis jenis mikoriza dan pengamatan
Mahasiswa mengetahui jenis dan manfaat mikoriza
2x100 mnt
1. Hand out
2. Buku referensi terkait
3. Diskusi kelas
1.UTS 30%2.UAS 40%3.Quiz 10%4.Presentasi 20%
8 UTS 4.
9-10 Menguasai pengetahuan mikroba pengurat nitrat
Mahasiswa mampu menjelaskan tentang peranan mikroba pada peranan pada proses nitrifikasi dan denitrifikasi
Peran mikroba dalam proses nitrifikasi dan denitrifikasi
Mempelajari dan mendiskusikan tentang: proses nitrifikasi dan denitrifikasi bakteri pengurau nitrat
2x100 mnt
1. Hand out
2. Buku referensi terkait
Diskusi kelas
1.UTS 30%2.UAS 40%3.Quiz 10%4.Presentasi 20%
11 UTS
12-14
Menguasai pengetahuan tentang peran bakteri rhizozfer sebagai biokontrol dan PGPR serta interaksinya dengan lingkungan
Mhs mampu menguasai peran bakteri sebagai biokontrol dan PGPR serta interaksinya pada lingkungan
Menguasai pengetahuan tentang Interaksi akar dan bakteri dalam proses biokontrol penyakit tanaman serta Peran bakteri yang hidup bebas di lingkungan rhizozfer dalam mempercepat pertumbuhan makanan
Mempelajari dan mendiskusikan tentang: peran bakteri sebagai biokontrol dan PGPR
2x100 mnt
1. Hand out2. Buku
referensi terkait
3. Diskusi kelas
UTS 30%2.UAS 40%3.Quiz 10%4.Presentasi 20%
15 Presentasi 1 x 100 mnt
Presentasi 20%
16 UAS UAS 40 %
Referensi
Nishizawa, T., M. Zhaorigetu, Y. Komatsuzaki, N. Sato, Kaneko, and H. Ohta. 2010. Molecular Characterization of Fungal Communities in Non-Tilled, Cover-Cropped Upland Rice Field Soils. Microbes and Environment 25(3):204–210. [cited on 4 Nov.2011.] Available from: http:// wwwsoc. nii.ac.jp/ jsme2/ doi:10.1264/jsme2.ME10108.
Miyadoh., M. Misa, R. Lilis, R. Roni, and I.R. Rasti. 2009. Taxonomic and Ecologicl Studies of Fungi and Actinomycetes in Indonesia., vol 2. Join Research Project between LIPI and NITE Japan. Penerbit LIPI Jakarta.
Minas, W., J.E. Bailey, and W. Duetz. 2001. Streptomycetes in micro-cultures: Growth, production of secondary metabolites, and storage and retrieval in the 96-well format. Kluwer Academic Publishers. Zurich.
Madigan, M. T. and J.M. Martinko, and J. Parker. 2003. Brock Biology of Microorganisms. Eight edition. Prentice Hall, Inc. New Jersey
Lechevalier, H.A., and S.A Waksman. 1973. Guide to the Classification and Identification of the Actinomycetes and their Antibiotics. Waverly Press Inc. USA.
Brundrett, M. 2004. Diversity and classification of mycorrhizal associations.
Brundrett, M., N. Bougher, B. Dell,. T. Grove, dan N. Malajczuk. 2008. Working with Mycorrhizas in Forestry and Agriculture. ACIAR Monograph 32. Australian Centre for International Agricultural Research, Canberra.
Hapsoh, 2008. Pemanfaatan Fungi Mikoriza Arbuskula pada Budidaya Kedelai di Lahan Kering. Makalah. Pengukuhan Guru Besar. 14 Juni 2008. Kampus USU. Medan. pp 35
Miyasaka, S.C., M. Habte, J.B. Friday and E.V. Johnson. 2003. Manual on arbuscular mycorrhizal fungus production and inoculation techniques. Soil and Crop Management 5: 4.
Powel C.L. and D.J. Bagyaraj.1984. Field inoculation with VA mycorrhizal fungi. In VA-Mycorrhizae. CRC Press. Florida. pp 205-222
Rao, N.S.S.1994. Mikroorganisme tanah dan pertumbuhan tanaman. UI Press.Jakarta
Glick, B.R. and Y.Bashan.1997. Genetic manipulation of plant growth promoting rhizobacteria to enhance biocontrol of phytopathogen. Biotecnology Advance 15:353-378
Haggag,W.M. H.A.Latief. A.Muhamed.2007.Biotecnological aspect of microorganism used in plant biological control. American Eurasian J.of Sust.Agric.1(1):7-12
Satuan Acara Perkuliahan (SAP)
1. MATA KULIAH Mikrobiologi Tanah
2. KODE MATA KULIAH
3. jumlah SKS 3
4. WAKTU PERTEMUAN 2 x 50menit
5. PERTEMUAN KE- 1
6. INDIKATOR PENCAPAIAN
Mahasiswa dapat memahami dan menerangkan Mikroorganisme penghuni tanah (autokton dan zimogen) dan Interaksi mikroorganisme dengan lingkungan
7. MATERI POKOK Pengantar tentang mikrobiologi tanah dan mikroorganisme penghuni tanah meliputi bakteri, jamur dan interaksinya dengan lingkungan
8. PENGALAMAN BELAJAR
Mengetahui dan menganalisa mikroorganisme penghuni tanah dan interaksinya dengan lingkungan melalui pemaparan, diskusi dan unjuk kerja (presentasi)
STRATEGI PEMBELAJARAN
TAHAPAN KEGIATAN DOSEN KEGIATAN MAHASISWA PENILAIAN
(1) (2) (3) (4)
Pembukaan Pengantar tentang Mikrobiologi tanah dan limbah
Melihat, mendengarkanpenjelasan, sertamencatat
Kehadiran
Penyajian Pembahasan tentang keberadaan dari mikroorganisme penghuni tanah baik bakteri, jamur, virus dan interaksinya dengan lingkungan
Menjelaskan dan diskusi dua arah factor-faktor yang berperan terhadap keberadaan mikroorganisme penghuni tanah
Melihat, mendengarkanpenjelasan, sertamencatat
1. Kehadiran2. Keseriusan3. Kemampuan
menjawab
Penutup Merangkum materi yang telah dibahas
Menyimak, mengajukan pertanyaan dan pendapat dalam diskusi
Idem
Media dan Alat Pembelajaran
Komputer, LCD, White board, spidol
Referensi Miyadoh., M. Misa, R. Lilis, R. Roni, and I.R. Rasti. 2009. Taxonomic and Ecologicl Studies of Fungi and Actinomycetes in Indonesia., vol 2. Join Research Project between LIPI and NITE Japan. Penerbit LIPI Jakarta.
Minas, W., J.E. Bailey, and W. Duetz. 2001. Streptomycetes in micro-cultures: Growth, production of secondary metabolites, and storage and retrieval in the 96-well format. Kluwer Academic Publishers. Zurich.Madigan, M. T. and J.M. Martinko, and J. Parker. 2003. Brock Biology of Microorganisms. Eight edition. Prentice Hall, Inc. New Jersey
Dosen : Dr.Dra.Retno Kawuri.M.Phil
Tandatangan
Satuan Acara Perkuliahan (SAP)
1. MATA KULIAH Mikrobiologi Tanah
2. KODE MATA KULIAH
3. jumlah SKS 3
4. WAKTU PERTEMUAN 2 x 50menit
5. PERTEMUAN KE- 2
6. INDIKATOR PENCAPAIAN
Mahasiswa dapat memahami dan menerangkan metoda umum yang digunakan untuk memisahkan dan mempelajari mikroorganisme tanah.
7. MATERI POKOK Cara pengambilan sampel tanah, isolasi dan identifikasi serta menghitung populasi
8. PENGALAMAN BELAJAR
Mengetahui dan menganalisa metoda yang digunakan dalam mengisolasi mengidentifikasi mdan mengitung totak mikroba.
STRATEGI PEMBELAJARAN
TAHAPAN KEGIATAN DOSEN KEGIATAN MAHASISWA PENILAIAN
(1) (2) (3) (4)
Pembukaan
Pengantar tentang bakteri populasi mikroba tanah
Melihat, mendengarkanpenjelasan, sertamencatat
Kehadiran
Penyajian Menjelaskan dan diskusi tentang cara identifikasi dan isolasi dan pelarutan tanah dan perhitungan lempeng
Menjelaskan dan diskusi dua arah metoda MPN untuk Nitrobacter, kultur diperkaya dan pengamatan langsung dengan mikroskop
Melihat, mendengarkan penjelasan, sertamencatat
1.Kehadiran2.Keseriusan3.Kemampuan menjawab
Penutup Merangkum materi yang telah dibahas
Menyimak, mengajukan pertanyaan dan pendapat dalam diskusi
Idem
Media dan Alat Pembelajaran
Komputer, LCD, White board, spidol
Referensi Brockwell.J.1981.A Strategi for legume nodulation research in developing regions of the old world. Plant Soil 58:367-382.
Somasegaran,P and H.J.Hoben. 1994. Handbook for Rhizobia.. Springer-Verlag. New York.
Madigan, M. T. and J.M. Martinko, and J. Parker. 2003. Brock Biology of Microorganisms. Eight edition. Prentice Hall, Inc. New Jersey
Dosen : Dr.Dra.Retno Kawuri.M.Phil
Tandatangan
Satuan Acara Perkuliahan (SAP)
1. MATA KULIAH Mikrobiologi Tanah
2. KODE MATA KULIAH
3. jumlah SKS 3
4. WAKTU PERTEMUAN 2 x 50menit
5. PERTEMUAN KE- 3
6. INDIKATOR PENCAPAIAN
Mahasiswa dapat memahami dan menerangkan Bakteri Rhizobium sebagai pupuk hayati serta cara pembuatan dan aplikasinya.
7. MATERI POKOK Pengertian Rhizobium , cara isolasi dan identifikasi Rhizobium, proses terjadinya simbiosis, faktor-faktor yang menghambat proses simbiosis dan aplikasi Rhizobium sebagai pupuk hayatiRhizobium sebagai pupuk hayati
8. PENGALAMAN BELAJAR
Mengetahui dan menganalisa keuntungan penggunaan pupuk hayati dari Rhizobium melalui pemaparan, diskusi dan unjuk kerja (presentasi)
STRATEGI PEMBELAJARAN
TAHAPAN KEGIATAN DOSEN KEGIATAN MAHASISWA PENILAIAN
(1) (2) (3) (4)
Pembukaan
Pengantar tentang bakteri Rhizobium, keberadaan dan manfaat
Melihat, mendengarkanpenjelasan, sertamencatat
Kehadiran
Penyajian Menjelaskan dan diskusi tentang cara identifikasi dan isolasi dan Menjelaskan bagaimana mekanisme simbiosis antara rhizobium dan tanaman inangnya
Menjelaskan dan diskusi dua arah Faktor-faktor yang menghambat dan mendukung proses simbiosis
Menjelaskan dan diskusi dua arah Pengaplikasiannya pupuk Rhizobium di laboratorium dan rumah kaca
Melihat, mendengarkanpenjelasan, sertamencatat
1.Kehadiran2.Keseriusan3.Kemampuan menjawab
Penutup Merangkum materi yang telah dibahas
Menyimak, mengajukan pertanyaan dan pendapat dalam diskusi
Idem
Media dan Alat
Komputer, LCD, White board, spidol
PembelajaranReferensi Brockwell.J.1981.A Strategi for legume nodulation research in developing
regions of the old world. Plant Soil 58:367-382.
Somasegaran,P and H.J.Hoben. 1994. Handbook for Rhizobia.. Springer-Verlag. New York.
Madigan, M. T. and J.M. Martinko, and J. Parker. 2003. Brock Biology of Microorganisms. Eight edition. Prentice Hall, Inc. New Jersey
Dosen : Dr.Dra.Retno Kawuri.M.Phil
Tandatangan
Satuan Acara Perkuliahan (SAP)
1. MATA KULIAH Mikrobiologi Tanah
2. KODE MATA KULIAH
3. jumlah SKS 3
4. WAKTU PERTEMUAN 2 x 50menit
5. PERTEMUAN KE- 4
6. INDIKATOR PENCAPAIAN
Mahasiswa dapat memahami dan menerangkan ekologi dari bakteri bintil akar (RNB)
7. MATERI POKOK Pengertian mengenai RNB yaitu tingkah laku bakteri RNB dalam beradaptasi terhadap lingkungan sehingga mampu untuk bertahan pada tanah
8. PENGALAMAN BELAJAR
Mengetahui dan menganalisa factor yang mempengaruhi bakteri RNB melalui pemaparan, diskusi dan unjuk kerja (presentasi)
STRATEGI PEMBELAJARAN
TAHAPAN KEGIATAN DOSEN KEGIATAN MAHASISWA PENILAIAN
(1) (2) (3) (4)
Pembukaan
Pengantar ekologi dari bakteri RNB
Melihat, mendengarkanpenjelasan, sertamencatat
Kehadiran
Penyajian Menjelaskan dan diskusi tentang Tingkah laku bakteri RNB dalam beradaptasi terhadap lingkungan sehingga mampu untuk tumbuh dan bertahanh pada tanah
Menjelaskan dan diskusi dua arah Beberapa metoda untuk mengidentifikasi RNB dan pengukuran aktivitas RNB pada tanah
Menjelaskan dan diskusi dua arah Fisiologi bakteri RNB toleransi terhadap stress fisik interaksi biotik dan distribusi RNB
Melihat, mendengarkanpenjelasan, sertamencatat
1.Kehadiran2.Keseriusan3.Kemampuan menjawab
Penutup Merangkum materi yang telah dibahas
Menyimak, mengajukan pertanyaan dan pendapat dalam diskusi
Idem
Media dan Alat Pembelajar
Komputer, LCD, White board, spidol
an
Referensi Brockwell.J.1981.A Strategi for legume nodulation research in developing regions of the old world. Plant Soil 58:367-382.
Somasegaran,P and H.J.Hoben. 1994. Handbook for Rhizobia.. Springer-Verlag. New York.
Madigan, M. T. and J.M. Martinko, and J. Parker. 2003. Brock Biology of Microorganisms. Eight edition. Prentice Hall, Inc. New Jersey
Dosen : Dr.Dra.Retno Kawuri.M.Phil
Tandatangan
Satuan Acara Perkuliahan (SAP)
1. MATA KULIAH Mikrobiologi Tanah
2. KODE MATA KULIAH
3. jumlah SKS 3
4. WAKTU PERTEMUAN 2 x 50menit
5. PERTEMUAN KE- 5
6. INDIKATOR PENCAPAIAN
Mahasiswa dapat memahami dan menerangkan Streptomyces sebagai biobakterisida
7. MATERI POKOK Bakteri Streptomyces , cara isolasi antibiotika dan enzim, dan cara aplikasinya sebagai biobakterisida.
8. PENGALAMAN BELAJAR
Mengetahui dan mempelajari pembuatan dan penggunaan Streptomyces sebagai biobakterisida melalui pemaparan, diskusi dan unjuk kerja (presentasi)
STRATEGI PEMBELAJARAN
TAHAPAN KEGIATAN DOSEN KEGIATAN MAHASISWA PENILAIAN
(1) (2) (3) (4)
Pembukaan
Pengantar tentang Streptomyces penghasil antibiotika
Melihat, mendengarkanpenjelasan, sertamencatat
Kehadiran
Penyajian Menjelaskan dan diskusi isolasi metabolit primer yaitu enzim dan metabolit sekunder yaitu antibiotika sebagai biobakterisida
Menjelaskan dan diskusi dua arah aplikasi Streptomyces sebagai biobakterisida di labolatorium, rumah kaca dan di lapangan
Melihat, mendengarkan penjelasan, sertamencatat
1.Kehadiran2.Keseriusan3.Kemampuan menjawab
Penutup Merangkum materi yang telah dibahas
Menyimak, mengajukan pertanyaan dan pendapat dalam diskusi
Idem
Media dan Alat Pembelajaran
Komputer, LCD, White board, spidol
Referensi Neidhart, F.C., J.L. Ingraham, and M. Schaecter. 1990. Physiology of the bacteriology cell; A Molecular Approach. Sinaver Assoc. Inc. New York.Narayana, K. J. P., P. Prabhakar, M. Vijayalakshmi, Y. Venkateswarlu, and P.S.J. Krishna. 2007. Study on bioactive compounds from Steptomyces sp. ANU 6277. Polish Journal of Microbiology 57(1): 35-39.Nishizawa, T., M. Zhaorigetu, Y. Komatsuzaki, N. Sato, Kaneko, and H. Ohta. 2010. Molecular Characterization of Fungal Communities in Non-Tilled, Cover-Cropped Upland Rice Field Soils. Microbes and Environment 25(3):204–210. [cited on 4 Nov.2011.] Available from: http:// wwwsoc. nii.ac.jp/ jsme2/ doi:10.1264/jsme2.ME10108.
Miyadoh., M. Misa, R. Lilis, R. Roni, and I.R. Rasti. 2009. Taxonomic and Ecologicl Studies of Fungi and Actinomycetes in Indonesia., vol 2. Join Research Project between LIPI and NITE Japan. Penerbit LIPI Jakarta.
Minas, W., J.E. Bailey, and W. Duetz. 2001. Streptomycetes in micro-cultures: Growth, production of secondary metabolites, and storage and retrieval in the 96-well format. Kluwer Academic Publishers. Zurich.
Madigan, M. T. and J.M. Martinko, and J. Parker. 2003. Brock Biology of Microorganisms. Eight edition. Prentice Hall, Inc. New Jersey
Lechevalier, H.A., and S.A Waksman. 1973. Guide to the Classification and Identification of the Actinomycetes and their Antibiotics. Waverly Press Inc. USA.
Dosen : Dr.Dra.Retno Kawuri.M.Phil
Tandatangan
Satuan Acara Perkuliahan (SAP)
1. MATA KULIAH Mikrobiologi Tanah
2. KODE MATA KULIAH
3. jumlah SKS 3
4. WAKTU PERTEMUAN 2 x 50menit
5. PERTEMUAN KE- 6
6. INDIKATOR PENCAPAIAN
Mahasiswa dapat memahami dan menerangkan Mikoriza
7. MATERI POKOK Pengertian Mikoriza Mikoriza dan interaksinya dengan tumbuhan vascular, Jenis-jenis mikoriza peranan mikoriza terhadap tanaman dan ekosistem serta mekanisme simbiosis mikoriza dengan tumbuhan
8. PENGALAMAN BELAJAR
Mengetahui dan mempelajari Mikoriza dan melalui pemaparan, diskusi dan unjuk kerja (presentasi)
STRATEGI PEMBELAJARAN
TAHAPAN KEGIATAN DOSEN KEGIATAN MAHASISWA PENILAIAN
(1) (2) (3) (4)
Pembukaan
Menjelaskan cakupan materi (termasuk pembuatan paper tiap mahasiswa dan presentasi paper)
Melihat, mendengarkanpenjelasan, sertamencatat
Kehadiran
Penyajian Kuliah dan diskusi cakupan materi mikoriza, disertai contoh-contoh mikoriza
Menjelaskan dan diskusi dua arah bagaimana cara interaksi/simbiosis dengan tanaman inangnya
Menjelaskan dan diskusi dua arah factor-faktor yang berperan terhadap simbiosis mikoriza dan tanaman inang
Melihat, mendengarkan penjelasan, sertamencatat
1.Kehadiran2.Keseriusan3.Kemampuan menjawab
Penutup Merangkum materi yang telah dibahas
Menyimak, mengajukan pertanyaan dan pendapat dalam diskusi
Idem
Media dan AlatPembelajaran
Komputer, LCD, White board, spidol
Referensi Brundrett, M. 2004. Diversity and classification of mycorrhizal associations.
Brundrett, M., N. Bougher, B. Dell,. T. Grove, dan N. Malajczuk. 2008. Working with Mycorrhizas in Forestry and Agriculture. ACIAR Monograph 32. Australian Centre for International Agricultural Research, Canberra.
Hapsoh, 2008. Pemanfaatan Fungi Mikoriza Arbuskula pada Budidaya Kedelai di Lahan Kering. Makalah. Pengukuhan Guru Besar. 14 Juni 2008. Kampus USU. Medan. pp 35
Miyasaka, S.C., M. Habte, J.B. Friday and E.V. Johnson. 2003. Manual on arbuscular mycorrhizal fungus production and inoculation techniques. Soil and Crop Management 5: 4.
Powel C.L. and D.J. Bagyaraj.1984. Field inoculation with VA mycorrhizal fungi. In VA-Mycorrhizae. CRC Press. Florida. pp 205-222
Dosen : Dr.Dra. Meitini.Wahyuni Proborini. M.Sc.St
Tandatangan
Satuan Acara Perkuliahan (SAP)
1. MATA KULIAH Mikrobiologi Tanah
2. KODE MATA KULIAH
3. jumlah SKS 3
4. WAKTU PERTEMUAN 2 x 50menit
5. PERTEMUAN KE- 6
6. INDIKATOR PENCAPAIAN
Mahasiswa dapat memahami dan menerangkan metode dan prinsip pengamatan mikoriza
7. MATERI POKOK Metode pengamatan mikoriza
8. PENGALAMAN BELAJAR
Mengetahui dan mempelajari metode pengamtatan mikoriza melalui pemaparan, diskusi dan unjuk kerja (presentasi)
STRATEGI PEMBELAJARAN
TAHAPAN KEGIATAN DOSEN KEGIATAN MAHASISWA PENILAIAN
(1) (2) (3) (4)
Pembukaan
Diskusi materi minggu lalu yang belum terselesaikan
Melihat, mendengarkanpenjelasan, sertamencatat
Kehadiran
Penyajian Menjelaskan dan diskusi tentang metode pengamatan mikoriza.
Melihat, mendengarkan penjelasan, sertamencatat
1.Kehadiran2.Keseriusan3.Kemampuan menjawab
Penutup Merangkum materi yang telah dibahas
Menyimak, mengajukan pertanyaan dan pendapat dalam diskusi
Idem
Media dan Alat Pembelajaran
Komputer, LCD, White board, spidol
ReferensiPowel C.L. and D.J. Bagyaraj.1984. Field inoculation with VA mycorrhizal fungi. In VA-Mycorrhizae. CRC Press. Florida. pp 205-222
Sieverding E 1991. Vesicular-Arbuscular Mycorrhiza Management in Tropical Agrosystems. GTZ, Eschborn, Germany.Simanungkalit, R. D. M. 2003. Teknologi cendawan Mikoriza Arbuskuler: Produksi inokulan dan pengawasan mutunya.Smith, S.E. and D.J. Read. 1997. Mycorrhizal Symbiosis. (2nd edition). Academic Press, London. 605pp. Brundrett, M., N. Bougher, B. Dell,. T. Grove, dan N. Malajczuk. 2008. Working with Mycorrhizas in Forestry and Agriculture. ACIAR Monograph 32.
Dosen : Dr.Dra. Meitini.Wahyuni Proborini. M.Sc.St
Tandatangan
Satuan Acara Perkuliahan (SAP)
1. MATA KULIAH Mikrobiologi Tanah 2. KODE MATAKULIAH3. WAKTU PERTEMUAN 2 x50 menit4. PERTEMUAN KE- 75. INDIKATOR PENCAPAIAN
Mahasiswa mampu menjelaskan tentang peranan mikroba pada proses nitrifikasi
6. MATERI POKOK Peran mikroba pada proses nitrifikasi7. PENGALAMAN BELAJAR
Mempelajari dan mendiskusikan tentang: Peran mikroba dalam proses nitrifikasi pada tanaman legumSTRATEGI PEMBELAJARAN
TAHAPAN KEGIATAN KEGIATAN MAHASISWA
MEDIA DANALAT
PEMBELAJARAN(1) (2) (3) (4)
Pembukaan Memberikan ulasan umum tentang materi yang akan dibahas
Melihat, mendengarkan penjelasan, dan mencatat
Kontrak perkuliahan, silabus, SAP, buku teks, tugas terstruktur,power pointpresentation, lap top, LCD
Penyajian Menjelaskan tentang:Menjelaskan dan diskusi tentang proses nitrifikasi dan factor factor penghambat nitrifikasi pada tanaman legum
Melihat, mendengarkan penjelasan, mencatat dan berdiskusi
Idem
Penutup Merangkum materi yang telah dibahas
Menyimak, mengajukan pertanyaan dan pendapat dalam diskusi
Idem
Post Test Pertanyaan lisan, penilaian/evaluasi terhadap proses pembelajaran, dan penilaian terhadap unjuk sikap
ReferensiSomasegaran,P and H.J.Hoben. 1994. Handbook for Rhizobia.. Springer-Verlag. New York.
Madigan, M. T. and J.M. Martinko, and J. Parker. 2003. Brock Biology of Microorganisms. Eight edition. Prentice Hall, Inc. New Jersey
Dosen : Drs IBG Darmayasa M.Si
Tanda Tangan
Satuan Acara Perkuliahan (SAP)
1. MATA KULIAH Mikrobiologi Tanah 2. KODE MATAKULIAH -3. WAKTU PERTEMUAN 2 x 50 menit4. PERTEMUAN KE- 85. INDIKATOR Mahasiswa mampu menjelaskan tentang peranan
PENCAPAIAN mikroorganisme dalam proses denitrifikasi6. MATERI POKOK Peran mikroba dalam proses dentrifikasi pada tanaman legum7. PENGALAMAN BELAJAR
Mempelajari dan mendiskusikan tentang: peranan mikroba dalam peristiwa perubahan nitrat dan nitrit menjadi nitrogen molekuler atau oksida nitrogenSTRATEGI PEMBELAJARAN
TAHAPAN KEGIATAN KEGIATAN MAHASISWA
MEDIA DANALAT
PEMBELAJARAN(1) (2) (3) (4)
Pembukaan Memberikan ulasan umum tentang materi yang dibahas
Melihat, mendengarkan penjelasan, dan mencatat
SAP, buku teks, tugas terstruktur,power pointpresentation, lap top, LCD
Penyajian Menjelaskan tentang Proses denitrifikasi, reaksi kimia denitrifikasi, dekomposisi nitrogen dan derivatnya serta pembentukan amonia oleh berbagai mikroba
Melihat, mendengarkan penjelasan, mencatat dan berdiskusi
Idem
Penutup Merangkum materi yang telah dibahas
Menyimak, mengajukan pertanyaan dan pendapat dalam diskusi
Idem
Post Test Pertanyaan lisan, penilaian/evaluasi terhadap proses pembelajaran, dan penilaian terhadap unjuk sikap
ReferensiSomasegaran,P and H.J.Hoben. 1994. Handbook for Rhizobia.. Springer-Verlag. New York.
Madigan, M. T. and J.M. Martinko, and J. Parker. 2003. Brock Biology of Microorganisms. Eight edition. Prentice Hall, Inc. New Jersey
Dosen : Drs IBG Darmayasa M.Si
Tanda Tangan
Satuan Acara Perkuliahan (SAP)
1. MATA KULIAH Mikrobiologi Tanah 2. KODE MATAKULIAH3. WAKTU PERTEMUAN 2 x 50 menit4. PERTEMUAN KE- 9
5. INDIKATOR PENCAPAIAN
Mhs mampu menguasai factor-faktor pembatas penggunaan legume di bidang pertanian
6. MATERI POKOK Pengertian tentang factor factor lingkungan yang menghambat dalam simbiosis tanaman legume dan inangnya
7. PENGALAMAN BELAJAR
Mempelajari dan mendiskusikan tentang: factor lingkungan sebagai pembatas simbiosis tanaman legumeSTRATEGI PEMBELAJARAN
TAHAPAN KEGIATAN KEGIATAN MAHASISWA
MEDIA DANALAT
PEMBELAJARAN(1) (2) (3) (4)
Pembukaan Memberikan ulasan umum tentang materi yang akan dibahas
Melihat, mendengarkan penjelasan, dan mencatat
Kontrak perkuliahan, silabus, SAP, buku teks, tugas terstruktur,power pointpresentation, lap top, LCD
Penyajian Menjelaskan tentang: faktor lingkungsn sebagai pembatas penggunaan legum yaitu salinitas, pH, temperatur, air, nitrogen terkombinasi, zat tumbuh dan faktor genetik
Melihat, mendengarkan penjelasan, mencatat dan berdiskusi
Idem
Penutup Merangkum materi yang telah dibahas
Menyimak, mengajukan pertanyaan dan pendapat dalam diskusi
Idem
Post Test Pertanyaan lisan, penilaian/evaluasi terhadap proses pembelajaran, dan penilaian terhadap unjuk sikap
ReferensiBrockwell.J.1981.A Strategi for legume nodulation research in developing regions of the old world. Plant Soil 58:367-382.Somasegaran,P and H.J.Hoben. 1994. Handbook for Rhizobia.. Springer-Verlag. New York.Madigan, M. T. and J.M. Martinko, and J. Parker. 2003. Brock Biology of Microorganisms. Eight edition. Prentice Hall, Inc. New Jersey
Dosen Drs Yan Ramona M.App.Sc, Ph.D.
Tanda Tangan
Satuan Acara Perkuliahan (SAP)
1. MATA KULIAH Mikrobiologi Tanah 2. KODE MATAKULIAH3. WAKTU PERTEMUAN 2 x 50 menit
4. PERTEMUAN KE- 105. INDIKATOR PENCAPAIAN
Menguasai tentang interaksi akar dan bakteri dalam proses biokontrol penyakit tanaman
6. MATERI POKOK Pengertian tentang bakteri yang dapat digunakan sebagai biokontrol pathogen tanaman
7. PENGALAMAN BELAJAR
Mempelajari dan mendiskusikan tentang pengendalian pathogen menggunakan biokontrolSTRATEGI PEMBELAJARAN
TAHAPAN KEGIATAN KEGIATAN MAHASISWA
MEDIA DANALAT
PEMBELAJARAN(1) (2) (3) (4)
Pembukaan Memberikan ulasan umum tentang materi yang akan dibahas
Melihat, mendengarkan penjelasan, dan mencatat
Kontrak perkuliahan, silabus, SAP, buku teks, tugas terstruktur,power pointpresentation, lap top, LCD
Penyajian Menjelaskan tentang: plant growth promoting bacteria PGPR, endophytes, biokontrol nematoda, eksistensi biokontrol pada patogen sistemik dan patogen daun
Melihat, mendengarkan penjelasan, mencatat dan berdiskusi
Idem
Penutup Merangkum materi yang telah dibahas
Menyimak, mengajukan pertanyaan dan pendapat dalam diskusi
Idem
Post Test Pertanyaan lisan, penilaian/evaluasi terhadap proses pembelajaran, dan penilaian terhadap unjuk sikap
Referensi Rao, N.S.S.1994. Mikroorganisme tanah dan pertumbuhan tanaman. UI Press.JakartaGlick, B.R. and Y.Bashan.1997. Genetic manipulation of plant growth promoting rhizobacteria to enhance biocontrol of phytopathogen. Biotecnology Advance 15:353-378
Haggag,W.M. H.A.Latief. A.Muhamed.2007.Biotecnological aspect of microorganism used in plant biological control. American Eurasian J.of Sust.Agric.1(1):7-12
Madigan, M. T. and J.M. Martinko, and J. Parker. 2003. Brock Biology of Microorganisms. Eight edition. Prentice Hall, Inc. New Jersey
Somasegaran,P and H.J.Hoben. 1994. Handbook for Rhizobia.. Springer-Verlag. New York.
Dosen : Drs Yan Ramona M.App.Sc, Ph.D.
Tanda Tangan
Satuan Acara Perkuliahan (SAP)
1. MATA KULIAH Mikrobiologi Tanah 2. KODE MATAKULIAH -3. WAKTU PERTEMUAN 2 x 50 menit4. PERTEMUAN KE- 115. INDIKATOR PENCAPAIAN
Mahasiswa mampu menjelaskan tentang peranan bakteri penghuni tanah yang dapat digunakan sebagai agen biokontrol
6. MATERI POKOK Pengembangan Biological control agent yang diisolasi dari tanah
7. PENGALAMAN BELAJAR
Mempelajari dan mendiskusikan tentang: pengendalian patogen tanaman dengan menggunakan biokontrolSTRATEGI PEMBELAJARAN
TAHAPAN KEGIATAN KEGIATAN MAHASISWA
MEDIA DANALAT
PEMBELAJARAN(1) (2) (3) (4)
Pembukaan Memberikan ulasan umum tentang materi yang dibahas
Melihat, mendengarkan penjelasan, dan mencatat
SAP, buku teks, tugas terstruktur,power pointpresentation, lap top, LCD
Penyajian Menjelaskan tentang a.Interaksi mikroba dalam
tanahb.Peran PGPR dalam biokontrolc.Mekanisme biokontrol (kompetisi, antibiosis, dll)
Melihat, mendengarkan penjelasan, mencatat dan berdiskusi
Idem
Penutup Merangkum materi yang telah dibahas
Menyimak, mengajukan pertanyaan dan pendapat dalam diskusi
Idem
Post Test Pertanyaan lisan, penilaian/evaluasi terhadap proses pembelajaran, dan penilaian terhadap unjuk sikap
Referensi Glick, B.R. and Y.Bashan.1997. Genetic manipulation of plant growth promoting rhizobacteria to enhance biocontrol of phytopathogen. Biotecnology Advance 15:353-378
Haggag,W.M. H.A.Latief. A.Muhamed.2007.Biotecnological aspect of microorganism used in plant biological control. American Eurasian J.of Sust.Agric.1(1):7-12
Madigan, M. T. and J.M. Martinko, and J. Parker. 2003. Brock Biology of Microorganisms. Eight edition. Prentice Hall, Inc. New Jersey
Dosen : Drs Yan Ramona M.App.Sc.Ph.D.Tanda Tangan
Satuan Acara Perkuliahan (SAP)
1. MATA KULIAH Mikrobiologi Tanah 2. KODE MATAKULIAH -3. WAKTU PERTEMUAN 2 x 50 menit4. PERTEMUAN KE- 125. INDIKATOR PENCAPAIAN
Mahasiswa mampu menjelaskan tentang peranan bakteri yang hidup pada rhizozfer tanaman
6. MATERI POKOK Peran bakteri rhizozfer7. PENGALAMAN BELAJAR
Mempelajari dan mendiskusikan tentang: peran bakteri rhizozfer dalam menghambat pathogen tanamanSTRATEGI PEMBELAJARAN
TAHAPAN KEGIATAN KEGIATAN MAHASISWA
MEDIA DANALAT
PEMBELAJARAN(1) (2) (3) (4)
Pembukaan Memberikan ulasan umum tentang materi yang dibahas
Melihat, mendengarkan penjelasan, dan mencatat
SAP, buku teks, tugas terstruktur,power pointpresentation, lap top, LCD
Penyajian Menjelaskan tentang Bakteri rhizozfer dalam mekanisme yang bersifat antibiosis, mekanisme ngrowth promotion secara langsung, strategi efektifitas PGPR
Melihat, mendengarkan penjelasan, mencatat dan berdiskusi
Idem
Penutup Merangkum materi yang telah dibahas
Menyimak, mengajukan pertanyaan dan pendapat dalam diskusi
Idem
Post Test Pertanyaan lisan, penilaian/evaluasi terhadap proses pembelajaran, dan penilaian terhadap unjuk sikap
Referensi Glick, B.R. and Y.Bashan.1997. Genetic manipulation of plant growth promoting rhizobacteria to enhance biocontrol of phytopathogen. Biotecnology Advance 15:353-378Haggag,W.M. H.A.Latief. A.Muhamed.2007.Biotecnological aspect of microorganism used in plant biological control. American Eurasian J.of Sust.Agric.1(1):7-12Madigan, M. T. and J.M. Martinko, and J. Parker. 2003. Brock Biology of Microorganisms. Eight edition. Prentice Hall, Inc. New Jersey
Dosen : Drs Yan Ramona M.App.Sc.Ph.D.Tanda Tangan
KONTRAK PERKULIAHAN
Nama Mata Kuliah : Mikrobiologi Tanah Kode Mata Kuliah : Pengajar : . Dr.Dra.Retno Kawuri.M.Phil
Drs.Yan Ramona.M.App.Sc.Ph.DDr.Dra.Meitini W.Proborini.M.Sc.St
Drs IBG Darmayasa M.SiSemester : GenapHari pertemuan/Jam : Rabu 10.30 – 12.10Tempat Pertemuan : Ruang BG BB
1. Manfaat Mata Kuliah
Mata kuliah inidiberikan pada mahasiswa untuk dapat memahami peran
mikroorganisme dalam tanah yang dapat dipergunakan baik sebagai penghasil pupuk
hayati, antibiotika, biokontrol patogen, proses nitrifikasi dan denitrifikasi oleh
mikroba penambat nitrogen , dan peran bakteri sebagai biokontrol pengendali hayati
terhadap patogen di tanaman. Mikoriza bermanfaat bagi pengelolaan lahan kering.
Penguasaan pengetahuan ini akan memberi manfaat bagi pola berpikir yang melandasi
kemampuan teknis dalam bersikap dan bertindak bagi pemanfaatan bakteri yang
berada di tanah.
2. Deskripsi Perkuliahan
Mata kuliah ini membahas tentang . Mikroorganisme dalam tanah dan
interaksinya dengan lingkungan, Metoda umum yang digunakan dalam
memisahkan dan mempelajari mikroorganisme tanah, mikroorganisme dalam
tanah yang bermanfaat dalam penggunaan sebagai pupuk hayati (Rhizobium) srta
factor-faktor pembatas penggunaan legume dan proses nitrifikasi dan denitrifikasi,
pemanfaatan Streptomyces sebagai biobakterisida, jenis jenis mikoriza dan
Metoda dan prinsip pengamatan mikoriza . Interaksi akar dan bakteri dalam proses
biokontrol penyakit tanaman
3. Standar Kompetensi
Setelah menyelesaikan matakuliah ini yaitu pada akhir semester mahasiswa
dapat memahami dan mengusaai pemanfaatan mikroorganisme dalam tanah bagi umat
manusia.
4. Kompetensi dasar
Memahami ilmu Mikrobiologi umum. Mikologi, Mikrobiologi lingkungan dan
Bioteknologi
5. StrategiPerkuliahan
Strategi instruksional yang digunakan pada mata kuliah ini terdiri dari:
a. Urutan kegiatan instruksional berupa: pendahuluan, cakupan materi pokok
bahasan, dan relevansi), penyajian (uraian, contoh, diskusi, evaluasi), dan penutup
(umpan balik, ringkasan materi, petunjuk tindak lanjut, pemberian tugas di rumah,
gambaran singkat tentang materi berikutnya)
b. Metode instruksional menggunakan: metode ceramah, demonstrasi, tanya-jawab,
diskusi kasus, dan penugasan.
Ceramah berupa penyampaian bahan ajar oleh dosen pengajar dan penekanan-
penekanan pada hal-hal yang penting dan bermanfaat untuk diterapkan
nantinya dalam praktek sebagai dokter umum.
Tanya jawab dilakukan sepanjang tatap muka, dengan memberikan
kesempatan mahasiswa untuk memberi pendapat atau pertanyaan tentang hal-
hal yang tidak mereka mengerti atau bertentangan dengan apa yang mereka
pahami sebelumnya.
Diskusi kasus dilakukan dengan memberikan contoh kasus/kondisi pada akhir
pokok bahasan, mengambil tema yang sedang aktual di masyarakat dan
berkaitan dengan pokok bahasan tersebut, kemudian mengajak mahasiswa
untuk memberikan pendapat atau menganalisis secara kritis kasus/kondisi
tersebut sesuai dengan pengetahuan yang baru mereka dapatkan.
Penugasan diberikan untuk membantu mahasiswa memahami bahan ajar,
membuka wawasan, dan memberikan pendalaman materi. Penugasan bisa
dalam bentuk menulis tulisan ilmiah, membuat review artikel ilmiah, ataupun
membuat tulisan yang membahas kasus/kondisi yang berkaitan dengan pokok
bahasan. Pada penugasan ini, terdapat komponen ketrampilan menulis ilmiah,
berpikir kritis, penelusuran referensi ilmiah, dan ketrampilan bahasa Inggris.
c. Media instruksionalnya berupa: LCD projector, whiteboard ,jurnal ilmiah, ,
handout, dan kontrak perkuliahan.
6. Materi Pokok
1. Mikroorganisme dalam tanah dan interaksinya dengan lingkungan
2. Metoda umum yang digunakan dalam memisahkan dan mempelajari
mikroorganisme tanah
3. Penggunaan mikroba sebagai pupuk hayati
4. Ekologi dari bakteri bintil akar
5. Streptomyces sebagai penghasil agen biobakterisida
6. Mikorhiza dan endomycorhiza
7. Metoda dan prinsip pengamatan mikoriza
8. Proses Nitrifikasi
9. Proses DeNitrifikasi
10. Faktor – factor pembatas dalam penggunaan legume di bidang pertanian
11. Interaksi akar dan bakteri dalam proses biokontrol penyakit tanaman
12. Peran bakteri yang hidup bebas di lingkungan rhizozfer dalam mempercepat
pertumbuhan makanan
13. Tugas mandiri, presentasi
7. BacaanPerkuliahan
Referensi
Nishizawa, T., M. Zhaorigetu, Y. Komatsuzaki, N. Sato, Kaneko, and H. Ohta. 2010. Molecular Characterization of Fungal Communities in Non-Tilled, Cover-Cropped Upland Rice Field Soils. Microbes and Environment 25(3):204–210. [cited on 4 Nov.2011.] Available from: http:// wwwsoc. nii.ac.jp/ jsme2/ doi:10.1264/jsme2.ME10108.
Miyadoh., M. Misa, R. Lilis, R. Roni, and I.R. Rasti. 2009. Taxonomic and Ecologicl Studies of Fungi and Actinomycetes in Indonesia., vol 2. Join Research Project between LIPI and NITE Japan. Penerbit LIPI Jakarta.
Minas, W., J.E. Bailey, and W. Duetz. 2001. Streptomycetes in micro-cultures: Growth, production of secondary metabolites, and storage and retrieval in the 96-well format. Kluwer Academic Publishers. Zurich.
Madigan, M. T. and J.M. Martinko, and J. Parker. 2003. Brock Biology of Microorganisms. Eight edition. Prentice Hall, Inc. New Jersey
Lechevalier, H.A., and S.A Waksman. 1973. Guide to the Classification and Identification of the Actinomycetes and their Antibiotics. Waverly Press Inc. USA.
Brundrett, M. 2004. Diversity and classification of mycorrhizal associations.
Brundrett, M., N. Bougher, B. Dell,. T. Grove, dan N. Malajczuk. 2008. Working with Mycorrhizas in Forestry and Agriculture. ACIAR Monograph 32. Australian Centre for International Agricultural Research, Canberra.
Hapsoh, 2008. Pemanfaatan Fungi Mikoriza Arbuskula pada Budidaya Kedelai di Lahan Kering. Makalah. Pengukuhan Guru Besar. 14 Juni 2008. Kampus USU. Medan. pp 35
Miyasaka, S.C., M. Habte, J.B. Friday and E.V. Johnson. 2003. Manual on arbuscular mycorrhizal fungus production and inoculation techniques. Soil and Crop Management 5: 4.
Powel C.L. and D.J. Bagyaraj.1984. Field inoculation with VA mycorrhizal fungi. In VA-Mycorrhizae. CRC Press. Florida. pp 205-222
Rao, N.S.S.1994. Mikroorganisme tanah dan pertumbuhan tanaman. UI Press.Jakarta
Glick, B.R. and Y.Bashan.1997. Genetic manipulation of plant growth promoting rhizobacteria to enhance biocontrol of phytopathogen. Biotecnology Advance 15:353-378
Haggag,W.M. H.A.Latief. A.Muhamed.2007.Biotecnological aspect of microorganism used in plant biological control. American Eurasian J.of Sust.Agric.1(1):7-12
8. Tugas
Dalam perkuliahan, diberikan beberapa tugas sebagai berikut:
a. Materi perkuliahan sebagaimana disebutkan dalam jadwal perkuliahan harus
sudah dibaca sebelum mengikuti tatap muka. Apabila ada, handout sudah akan
diserahkan pada mahasiswa sebelum hari kuliah.
b. Quiz diberikan pada tiap kali tatap muka untuk menilai pemahaman mahasiswa
dan absensi. Kehadiran pada tatap muka minimal 80%.
9. KriteriaPenilaian
Penilaian akan dilakukan oleh pengajar dengan menggunakan kriteria PAP sebagai
berikut:
Nilai dalam huruf Point Rentang skorA 4,0 80-100B 3 70-79C 2,0 60-69D 1,0 50-59E 0 00-49
Pembobotan nilai adalah sebagai berikut:Nilai Tugas Presentasi : 20% Nilai UTS : 30%Nilai UAS : 40%Nilai Quiz : 10%
10. Jadwal perkuliahan
Pertemuan
Topik Dosen Tanggal
1 Mikroorganisme dalam tanah dan interaksinya dengan lingkungan
Retno Kawuri
2 Metoda umum yang digunakan dalam memisahkan dan mempelajari mikroorganisme tanah
Retno Kawuri
3 Penggunaan mikroba sebagai pupuk hayati
Retno Kawuri
4 Ekologi dari bakteri bintil akar Retno Kawuri
5 Streptomyces sebagai penghasil agen biobakterisida
Retno Kawuri
6 Mikorhiza dan endomycorhiza Meitini WP
7 Metoda dan prinsip pengamatan mikoriza
Meitini WP
8 UTS I materi 1 - 7 Retno, Meitini9 Proses Nitrifikasi IBG Darmayasa
10 Proses DeNitrifikasi IBG Darmayasa
11 Faktor – factor pembatas dalam penggunaan legume di bidang pertanian
Yan Ramona
12 Interaksi akar dan bakteri dalam proses biokontrol penyakit tanaman
Yan Ramona
13 Peran bakteri yang hidup bebas di lingkungan rhizozfer dalam mempercepat pertumbuhan makanan
Yan Ramona
14 UTS, II materi 9-10 IBG Darmayasa , Y15 Presentasi mandiri Retno Kawuri16 UAS materi 11-13 Yan Ramona
Demikian kontrak perkuliahan ini dibuat, agar disetujui dan ditaati oleh semua pihak.
Denpasar, 2015
Menyetujui
Mahasiswa Mahasiswa
(.........................................) (........................)
Dosen/Koordinator MK
(Dr Dra Retno Kawuri. M.Phil)