Sintesis Protein

22
SINTESIS PROTEIN (TRANSLASI) RESUME untuk memenuhi tugas mata kuliah Genetika I yang dibimbing oleh Prof. Dr. A. Duran Corebima, M.Pd. Kelompok 14 Offering B Anggota: Didik Dwi Prastyo 130341624788 Imroatun Hasana 130341614818

description

genetika

Transcript of Sintesis Protein

SINTESIS PROTEIN (TRANSLASI)RESUMEuntuk memenuhi tugas mata kuliah Genetika Iyang dibimbing oleh Prof. Dr. A. Duran Corebima, M.Pd. Kelompok 14Offering B

Anggota:Didik Dwi Prastyo130341624788Imroatun Hasana130341614818

UNIVERSITAS NEGERI MALANG

FAKULTAS MATEMATIKA DAN ILMU PENGETAHUAN ALAM

JURUSAN BIOLOGI

Februari 2015

TranslasiTranslasi merupakan proses di mana informasi genetik (yang disimpan dalam urutan nukleotida dalam sebuah molekul mRNA) diterjemahkan. Setelah uraian kode genetik, dalam urutan asam amino berada didalam polipeptida gen-produk yang kompleks. Hal tersebut membutuhkan fungsi sejumlah besar molekules makro. Ini termasuk (1) lebih dari 50 polipeptida dan dari 3 sampai 5 molekul RNA hadir di setiap ribosom (komposisi yang tepat bervariasi dari spesies ke spesies), (2) paling sedikit 20 amino acid-activiting enzim (amynoacyl-tRNA sintetase), (3 ) 40 sampai 60 molekul tRNA yang berbeda, dan (4) setidaknya 9 protein larut terlibat dalam inisiasi rantai polipeptida, elongasi, dan terminasi. Karena banyak dari makromolekul ini, terutama komponen ribosom, yang hadir dalam kuantitas besar dalam setiap sel, sistem penerjemahan membuat sebagian besar dari mesin metabolisme setiap sel (Gardner, 1984).Proses penerjemahan terjadi pada ribosom. Struktur makromolekul kompleks terletak di sitoplasma. Translasi melibatkan tiga jenis RNA, yang semuanya ditranskripsi dari DNA template (gen kromosom). Selain mRNA, 3 sampai 5 RNA molekul (molekul rRNA) yang hadir sebagai bagian dari struktur masing-masing ribosom, dan 40-60 macam (seukuran 70-80 nukleotida) molekul RNA (molekul tRNA) berfungsi sebagai mediasi penggabungan asam amino yang tepat dalam menanggapi kodon spesifik di mRNA. Ribosom dapat dianggap sebagai workbenches, lengkap dengan mesin dan peralatan yang diperlukan untuk membuat polipeptida. Mereka nonspesifik dalam arti bahwa mereka dapat mensintesis setiap polipeptida (setiap urutan asam amino) yang ditentukan oleh molekul mRNA tertentu. Mengingat gambaran dangkal sintesis protein ini,

Gambar 1.1 Skema diagramatik sintesis protein (Snustad, 2012).Penelitian awal menggunakan pulse-label (dengan asam amino radioaktif) dan autoradiografi menunjukkan bahwa protein disintesis sebagian besar dalam sitoplasma di dalam bentukan kecil, tapi kompleks, struktur makromolekul yang disebut ribosom. Pada prokariota, ribosom didistribusikan di seluruh sel; pada eukariota, mereka berada dalam sitoplasma. Mereka terdiri dari dua subunit, satu besar dan satu kecil, yang memisahkan ketika terjemahan dari molekul mRNA selesai. Ukuran ribosom yang paling sering dinyatakan dalam tarif mereka sedimentasi selama sentrifugasi, dalam satuan yang disebut S atau unit Svedberg. Ribosom E.coli, seperti yang terdapat pada kenayakan prokariot, Memiliki berat molekul 2.7x106 dan "ukuran" dari "70S". Ribosom dari eukayotes besar (biasanya sekitar 80S). Namun, ukuran bervariasi dari spesies ke spesies. Ribosom hadir dalam organel (mitokondria dan kloroplas) sel eukariotik yang kecil (biasanya sekitar 60S) (Gardner, 1984).Dalam semua kasus, masing-masing ribosom terdiri dari dua subunit. Dalam kasus E.coli, yang kecil (30S) subunit ribosom mengandung 16S (mol. Wt. Tentang 6x105) molekul RNA ditambah 21 polipeptida yang berbeda, dan besar (50S) subunit mengandung dua molekul RNA (5S, mol. Wt. Tentang 4x104, dan 23S, mol. Wt. Tentang 1.2x106) ditambah 31 polipeptida. Dalam ribosom eukariotik, subunit kecil berisi 18S (ukuran rata-rata) molekul RNA dan subunit besar berisi 5S, sebuah 5,8S dan 28S (ukuran rata-rata) molekul RNA. Ribosom pada Drosophila juga tampak mengandung molekul RNA 2S kecil. Di organel, ukuran rRNA yang sesuai adalah 5S, 13S, 21S (Gardner, 1984).Dalam kasus E.coli, M. Nomura dan rekan-rekannya telah mampu sepenuhnya memisahkan subunit 30S ribosom ke dalam makromolekul individu dan kemudian menyusun kembali 30S subunit fungsional dari komponen. Hal ini memungkinkan mereka untuk mempelajari fungsi (s) dari RNA dan protein molekul individu (Gardner, 1984).Molekul-molekul RNA ribosom ditranskripsi dari template DNA, seperti molekul mRNA. Pada eukariota, sintesis rRNA terjadi di nukleus dan dikatalisis oleh RNA polimerase khusus hadir hanya dalam nukleolus. Terlebih lagi, transkripsi gen rRNA menghasilkan rRNA prekursor yang lebih besar dari molekul RNA ditemukan dalam ribosom. Prekursor rRNA menjalani proses posttranscriptional untuk menghasilkan molekul rRNA yang terlibat dalam terjemahan. Di E.coli, rRNA transkrip gen adalah prekursor 30S, yang mengalami pembelahan oleh endoribonucleases untuk menghasilkan 5S, 16S rRNA 28S Dan ditambah 4S molekul RNA transfer. Pada eukariota, 2S (saat sekarang), 5,8S, 18S, 28S rRNA dan dipotong dari 40S rRNA 45S ke (tergantung pada spesies) prekursor, sedangkan 5S rRNA dihasilkan oleh pengolahan posttranscriptional dari transript gen yang terpisah.Selain pemecahan posttranscriptional dari rRNA prekursor, metilasi posttranscriptional dari banyak nukleotida dalam rRNA terjadi. Metilasi melindungi molekul rRNA dari ribonucleases intraseluler yang terlibat dalam degradasi mRNA; Fungsi pastinya belum jelas, namun beberapa salinan dari gen untuk rRNA yang hadir dalam genom dari semua organisme dipelajari untuk saat ini. Hal ini tidak mengherankan mengingat sejumlah besar ribosom hadir pada setiap sel. Di E.coli, ada diperkirakan 5-10 salinan rRNA (RRN) gen, dengan setidaknya satu salinan di masing-masing tiga lokasi yang berbeda pada kromosom tersebut. Pada eukariota, gen rRNA yang hadir dalam ratusan hingga ribuan eksemplar. The 5,8S-18S rRNA 28S-gen eukariota yang hadir dalam duplikasi tandem di daerah penyelenggara nukleolus dari kromosom. Dalam beberapa eukariota, seperti jagung, ada satu pasang penyelenggara nukleolus (pada pasangan kromosom 6 pada jagung). Manusia, memiliki lima pasang penyelenggara nukleolus, yang terletak di lengan pendek kromosom 13,14,15,21, dan 22. penelitian yang cermat menunjukkan bahwa ada sekitar 500 eksemplar dari 5,8S-18S-28S gen rRNA nukleolus di Xenopus laevis. Tingkat yang sama redundansi telah diperkirakan penghematan di beberapa hewan lain. Tanaman menunjukkan variasi yang lebih besar dalam rRNA redundansi gen, dengan beberapa ribu eksemplar hadir di beberapa genom. Intraspesies variasi dalam jumlah rRNA redundansi gen juga telah didokumentasikan dalam beberapa spesies (Gardner, 1984).Gen 5S rRNA pada Eukariota yang tidak terletak di daerah nukleolus. Sebaliknya, mereka biasanya didistribusikan ke beberapa kromosom. Mereka sangat berlebihan, seperti gen 5,8S-18S rRNA 28S-. Walaupun ribosom menyediakan tempat yang diperlukan untuk sintesis protein, dan spesifikasi untuk setiap polipeptida yang dikodekan dalam molekul mRNA, terjemahan dari pesan mRNA terkode menjadi urutan asam amino dalam apolypeptide membutuhkan satu kelas tambahan molekul RNA, transfer RNA (tRNA) molekul. Pertimbangan kimia menunjukkan bahwa interaksi langsung antara asam amino dan urutan nukleotida atau kodon pada mRNA (kodon adalah urutan nucleotid dalam mRNA yang menentukan penggabungan satu asam amino) tahun 1958. Oleh karena itu Crick mengusulkan bahwa beberapa jenis dari "adapter" molekul asam amino yang menengahi kodon pengakuan selama sintesis protein. The "adapter" molekul segera diidentifikasi dan ditemukan untuk menjadi kecil (4S, 70-80 nukleotida panjang) molekul RNA. Molekul-molekul ini, pertama kali disebut "RNA larut" (Srna) molekul dan kemudian mentransfer RNA (tRNA) molekul, mengandung urutan basa triplet, yang disebut urutan antikodon, yang melengkapi dan mengakui urutan kodon dalam terjemahan mRNA. Ada dari satu sampai empat tRNA dikenal untuk setiap asam amino (Gardner, 1984).

Gambar 1.3 Transkripsi dari gen E.coli yang menghasilkan 30s rRNA prekursor (Snustad, 2012).Asam amino yang melekat pada tRNA dengan energi tinggi (sangat reaktif) ikatan antara gugus karboksil dari asam amino dan termini 3'-hidroksil dari tRNA. Aminoasil tRNA ini reaktif terbentuk dalam dua-langkah proses, baik langkah yang dikatalisasi oleh spesifik "mengaktifkan enzim" atau aminoasil-tRNA sintetase. Ada setidaknya satu aminoasil-tRNA sintetase untuk masing-masing 20 asam Amino. Langkah pertama dalam sintesis aminoasil-tRNA melibatkan aktivasi asam amino menggunakan energi dari Adenosin trifosfat (ATP): Asam amino - AMP intermadiate biasanya tidak dilepaskan dari enzim sebelum menjalani langkah kedua dalam aminoasil-tRNA sintesis, yaitu reaksi dengan tRNA yang sesuai:Aminoasil-tRNA (asam amino -tRNAs) adalah prekursor langsung sintesis polipeptida pada ribosom, dengan masing-masing tRNA diaktifkan kodon mRNA dan penyajian asam amino dalam konfigurasi sterik (struktur tiga dimensi) yang memfasilitasi pembentukan ikatan peptide (Gardner, 1984).Asam amino diikat pada tRNA oleh ikatan energi tinggi (sangat reaktif) antara kelompok karboksil dari asam amino dan ujung 3-hidroksil dari tRNAs. Aminoasil tRNAs yang reaktif ini dibentuk dalam 2 tahap, kedua tahap dikatalisis oleh enzim pengaktivasi yang spesifik yaitu aminoacyl-tRNA synthetase. Terdapat paling sedikit satu aminoacyl-tRNA sinthetase untuk setiap 20 asam amino. Tahap pertama yaitu sintesis aminoacyl-tRNA melibatkan aktivasi dari asam amino menggunakan energi dari ATP (Gardner, 1984).

Intermediet asam amino-AMP secara normal tidak dilepaskan dari enzim sebelum melalui tahap kedua pada sintesis aminoacyl-tRNA, reaksi dengan tRNA yang tepat:

Aminoacyl-tRNAs (asam amino-tRNAs) merupakan perekursor intermediet dari sintesis polipeptida pada ribosom, dengan masing-masing diaktivasi oleh tRNA yang mengenali kodon mRNA yang tepat dan menghasilkan asam amino dalam konfigurasi sterik (struktur tiga dimensi) yang memfasilitasi pembentukan ikatan peptida (Gardner, 1984).

Gambar 1.4 Susunan dari Ikatan Peptida antara Dua Asam Amino (Snustad, 2012).

Gambar 1.5 Struktur Tiga Dimensional dari Protein (Snustad, 2012).tRNAs ditranskrip dari gen kromosomal. tRNAs ditranskrip dalam bentuk molekul precursor besar yang menjalani proses posttranskripsional (pembelahan, trimming, metilasi dan sebagainya). Molekul tRNA dewasa mengandung beberapa nukleosida yang tidak terdapat pada mRNA atau transkrip gen tRNA primer. Nukleosida yang tidak biasa ini, seperti inosin, pseudoridin, dihidroridin, 1-metilguanosin, dan lainnya dihasilkan oleh posttranskripsional, enzim yang mengkatalisis modifikasi dari 4 nukleosida disatukan menjadi RNA saat transkripsi (Gardner, 1984).tRNAs ukurannya kecil, panjangnya 70-80 nukleotida. Sekuen nukleotida lengkap dengan struktur cloverleaf dari tRNA alanin ragi diusulkan oleh R.W. Holley dan koleganya tahun 1965. Semenjak itu, banyak tRNAs telah dirangkai, gen tRNA alanin ragi telah disintesis secara in vitro dari mononukleotida oleh H.G. Khorana dan timnya. Struktur tiga dimensi dari tRNA fenilalanin ragi telah ditetapkan dengan penelitian difraksi sinar X. Antikodon dari tRNA alanin dan fenilalanin ragi terbentuk dalam lingkaran (daerah ikatan nonhidrogen) dekat pusat molekul. Faktanya, antikodon dari seluruh sekuen tRNAs sampai saat ini (70 lebih dari seluruh organisme) telah ditemukan terletak dalam lingkaran antikodon (Gardner, 1984).

Gambar 1.6 Sekuen Nukleotida dan Konfigurasi Cloverleaf dari tRNA Alanin Ragi. Struktur sekunder dihasilkan oleh ikatan hidrogen antar dasar pada segmen berbeda dari molekul. Struktur tersebut mengandung tiga lingkaran, dengan tanpa base pairing yang terjadi. Satu dari lingkaran tersebut mengandung sekuen antikodon, pada kasus tRNA alanine ragi yaitu sekuen 3-CGI-5 (Snustad, 2012).Masing-masing ribosom memiliki 2 tempat ikatan tRNA yaitu A site dan P site. A atau aminoacyl site mengikat aminoacyl-tRNA yang datang, tRNA membawa asam amino yang selanjutnya akan ditambahkan untuk pemanjangan rantai polipeptida. P atau Peptidyl site mengikat tRNA ke pemanjangan polipeptida tersambung. Spesifikasi untuk ikatan aminoacyl-tRNA pada tempat ini ditentukan oleh kodon mRNA yang menyusun bagian A dan P binding site. Saat ribosom bergerak sepanjang mRNA, spesifikasi untuk aminoacyl-tRNA binding pada tempat A dan P berubah sebagai kodon mRNA yang berbeda yang berpindah ke register pada binding site. Ribosomal binding site dengan sendirinya (tanpa mRNA) mampu mengikat semua aminoacyl-tRNA (Gardner, 1984).

Gambar 1.7 Photograph (a) dan Gambar Interpretasi (b) dari Model Molekular tRNA Fenilalanin Ragi Berdasarkan Data Difraksi Sinar X. Lingkaran antikodon berada pada bagian bawah. Rangka ribosa-fosfat dari RNA digambar sebagai silinder yang terputus-putus. Tonggak mengindikasikan ikatan hydrogen base pair. Dasar yang tidak berpasangan diindikasikan oleh tangkai pendek (Snustad, 2012).

Gambar 1.8 Struktur Ribosom pada E. coli. Masing-masing ribosom/ komplek mRNA mengandung tiga aminoacyl-tRNA binding site. A atau aminoacyl-tRNA site ditempati oleh alanyl-tRNAala. P atau peptidyl-tRNA site ditempati oleh phenylalanyl-tRNAphe, dengan pemanjangan polipeptida dihubungkan secara kovalen pada phenylalanyl-tRNA. E atau exit site ditempati oleh Trnagly, untuk melepaskan dari ribosom (Snustad, 2012).Molekul RNA mengandung spesifisitas yang baik disamping ukurannya yang kecil. Tidak hanya itu, RNA harus:1. Mengandung sekuen antikodon yang tepat, agar kodonnya juga tepat

2. Dikenali oleh aminoacyl-RNA synthetase yang tepat, sehingga diaktivasi dengan asam amino yang tepat

3. Terikat pada A dan P site pada ribosom

F. Chapeville dan G. von Ehrenstein dan koleganya mengadakan eksperimen tentang spesifisitas untuk pengenalan kodon pada bagian tRNA dari aminoacyl-tRNA, dibandingkan dengan pada asam amino. Mereka menghilangkan cysteyl-tRNAcys (tRNA sistein yang diaktivasi oleh sistein) dengan mereduksi bubuk nikel secara kuat (Raney nikel), yang mengubah (reduksi) sistein menjadi alanine yang masih berikatan, akan tetapi pada cysteine tRNA. Saat hybrid aminoacyl-tRNA yaitu alanyl-tRNAcys telah digunakan pada protein sebagai sistem penyintesis secara in vitro, alanine telah ditemukan terdapat pada posisi dalam polipeptida yang secara normal ditempati oleh sistein (Gardner, 1984).Sintesis protein diinisiasi oleh tRNA initiator yang khusus yaitu tRNAfMet . Artinya seluruh polipeptida diawali oleh metionin saat sintesis. Amino yaitu metionin pada ujung setelah itu dipotong dari banyak polipeptida. Dengan demikian, protein fungsional tidak memiliki amino metionin pada ujungnya. Pada organel eukariot dan prokariot, metionin pada initiator tRNAfMet memiliki kelompok amino yang dihalangi dengan kelompok formyl (-CO-H). Pada sistem sitoplasmik eukariot, initiator tRNAfMet khusus juga hadir namun kelompok amino tanpa adanya formyl. Metionin tRNA yang berbeda yang merespon pada kodon metionin internal, hadir dalam sistem prokariot dan eukariot. Pada keduanya, tRNAs memiliki antikodon yang sama dan keduanya juga merespon pada kodon yang sama (AUG) untuk metionin. Pada prokariot, kelompok amino dengan formil pada tRNAfMet mencegah pembentukan ikatan peptida antara kelompok amino dan kelompok karboksil dari asam amino pada akhir dari pemanjangan rantai polipeptida. Pada eukariot, kelompok amino dari tRNAiMet tidak dihalangi. Apa yang mencegah tRNAiMet (i untuk inisiator) pada kodon AUG internal dan methionyl-tRNAMet dari respon inisiator kodon AUG pada mRNAs eukariot? hanya methionyl-tRNAMet yang bereaksi dengan protein faktor penginisiasi, IF-1, IF-2, dan IF-3, dan hanya methionyl-tRNAMet yang berinteraksi dengan protein faktor pemanjangan, EF-Ts dan EF-Tu. Pada banyak kasus, hanya methionyl-tRNAiMet yang merespon pada kodon inisiasi AUG dan hanya methionyl-tRNAMet yang merespon pada kodon internal AUG. Methionyl-tRNAfMet juga merespon pada kodon penginisasi pengganti yaitu GUG (kodon valin ketika hadir pada posisi internal), diketahui hadir pada beberapa mRNAs alami (Gardner, 1984).Pada prokariot, inisiasi rantai polipeptida terjadi dalam formasi komplek antar mRNA yaitu methionyl-tRNAfMet dan subunit ribosom 30S. Formasi dari komplek inisiasi ini membutuhkan aktivitas dari 3 protein faktor penginisiasi yaitu IF-1, IF-2, DAN IF-3 ditambah dengan guanosine triphosphate (GTP). Kemungkinan hal ini difasilitasi oleh interaksi base-pairing antara base sequence dekat akhir 3 dari 16S rRNA dan base sequence pada leader sequence dari mRNA. (leader sequence dari molekul mRNA adalah sekuen yang tidak ditranslasikan dari akhir 5 ke kodon penginisiasi AUG atau GUG pertama. Sekuen yang tidak ditranslasikan ini berbeda panjangnya dari beberapa nukleotida pada beberapa ratus nukteotida) (Gardner, 1984).Komplek penginisiasi selanjutnya bergabung dengan subunit ribosom 50S, dan methionyl-tRNAfMet menjadi terikat pada tempat peptidyl. Hal tersebut membutuhkan hidrolisis dari satu molekul GTP. Penjajaran dari kodon penginisiasi AUG dengan antikodon dari tRNAfMet (pada P site) mengatur kodon yang hadir pada A site, lalu mensabilkan spesifisitas unuk aminoacyl-tRNA binding pada A site. Contohnya ikatan dari alanyl-tRNAala pada A site (dan seluruh subsekuen ikatan aminoacyl-tRNA) membutuhkan hidrolisis satu molekul GTP dan faktor pemanjangan protein yaitu EF-Ts dan EF-Tu. Formasi ikatan peptida antara kelompok karboksil dari ikatan f-methionine pada tRNAfMet di P site dan kelompok amino dari molekul alanine berikatan dengan tRNAala pada A site selanjutnya dikatalisis oleh peptidyl transferase, yaitu enzim yang terikat pada subunit ribosom 50S. Reaksi ini menghasilkan dipeptida f-met-ala yang melekat pada tRNAala yang terikat pada A site dari ribosom (Gardner, 1984).Tahap selanjutnya pada translasi, dinamakan translokasi, melibatkan:

1. Perpindahan dari f-met-ala-tRNAala dari A site ke P site

2. Perpindahan dari molekul mRNA persisnya 3 nukleotida, relatif dari posisi ribosom, sehingga kodon sebelumnya masuk pada A site berpindah ke P site.Contohya kodon alanine GCC berpindah dari posisinya pada A site ke P site, dan kodon subsekuen yaitu kodon serin UCC berpindah masuk ke A site. Translokasi membutuhkan aktifitas dari elongation factor yaitu Ef-G dan hidrolisis satu molekul GTP (Gardner, 1984).Aminoacyl-tRNA selanjutnya dispesifikkan oleh kodon mRNA pada A site lalu terikat pada A site, dan pembentukan ikatan peptida dan tahap translokasi diulang. Sekuen diulang untuk masing-masing kodon mRNA (rata-rata sekitar 300 kodon) sampai rantai kodon terminasi dicapai. Kelompok formyl pada amino dengan ujung methionine biasanya dipindahkan dengan deformylase sebelum sintesis polipeptida selesai. Ketika satu dari tiga polipeptida rantai dengan terminasi kodon (UAG, UAA, atau UGA) masuk ke A site, polipeptida terbentuk, tRNA pada P site dan mRNA dilepaskan, dan subunit ribosom memisah. Terminasi membutuhkan aktivitas dari satu dari dua protein release factor yaitu RF-1 dan RF-2. Permisahan subunit ribosomal kemudian bebas untuk menginisiasi translasi dari molekul mRNA lain (Gardner, 1984).Dibandingkan masing-masing molekul mRNA yang ditranslasikan oleh ribosom tunggal, sebagian besar mRNA secara simultan ditranslasikan oleh beberapa ribosom, dengan jarak 90 nukleotida sepanjang molekul mRNA. Ukuran dari komplek translasi ini disebut polyribosomes atau polysome, sangat berubah-ubah namun berkorelasi dengan ukuran polipeptida yang disintesis. Rantai hemoglobin (sekitar 150 asam amino) disintesis komplek pentaribosom (rata-rata ukuran) (Gardner, 1984).Daftar PustakaGardner, E.J., dan Snustad, D.P. 1984. Principle of Genetics 6th edition. NewYork: John Wiley and Sons.Inc.

Snustad, D.P. dan Simmons, M.J. 2012. Principles of Genetics 6th edition. USA: John Wiley and Sons.Inc. (ebook).

Pertanyaan

1. Didik Dwi P.

Jelaskan perbedaan translasi pada eukariot dan prokariot !

Jawab: Pada prokariot, proses translasi dilakukan secara hampir serentak dengan proses transkripsi, artinya sebelum transkripsi selesai maka proses translasi sudah dimulai. Sebaliknya pada eukariot translasi baru dapat dilaksanakan jika proses transkripsi sudah selesai.2. Imroatun Hasana

Ribosom memiliki 3 site yaitu A site, P site, dan E site. Mengapa pada awal translasi tersebut AUG (kodon untuk metionin) langsung masuk pada P site sedangkan yang lain masuk dari A site?

Jawab: AUG adalah kodon dari metionin yang berfungsi sebagai kodon start pada proses translasi. Kodon start ini menstabilkan penerjemahan yang tepat untuk mRNA yang masuk. Prokariot dan eukariot mengandung dua tRNAs metionin yang berbeda yaitu tRNAiMet dan tRNAMet. tRNAiMet yang menginisiasi proses sintesis polipeptida (translasi) sedangkan tRNAMet dapat menggabungkan metionin hanya untuk pemanjangan rantai polipeptida. Hanya Met-tRNAiMet (dengan kata lain diaktivasi metionin yang melekat pada tRNAiMet) dapat berikatan pada P site untuk memulai sintesis rantai polipeptida dan tRNAs lain terikat hanya pada Asite. Oleh karena itu AUG langsungmasuk ke P site dengan alasan tRNA yang bertugas menerjemahkan metionin berada pada P site. Mengapa pada beberapa polipeptida mengandung sekuen asam amino pendek pada amino atau karboksil termini?

Jawab: Beberapa polipeptida mengandung sekuen asam amino pendek pada amino atau karboksil termini karena nantinya sekuen tersebut berfungsi sebagai sinyal untuk transportnya ke kompatemen sel yang spesifik seperti RE, mitokondria, kloroplas, atau nucleus. Contohnya protein sekretori yang mengandung sekuen sinya pendek pada amino terminus yang mengarahkannya ke membran dari RE.