Translate Enny Evluation

download Translate Enny Evluation

of 21

Transcript of Translate Enny Evluation

  • 7/26/2019 Translate Enny Evluation

    1/21

    Evaluasi Sistem Deteksi viabilitas-qPCR padaSalmonellaSerovar Enteritidis

    yang Hidup dan Mati

    Abstrak

    Propidium monoazide (PMA) ditambah dengan PCR (viabilitas PCR) digunakan

    dalam deteksi patogen yang dibawa oleh makanan hanya untuk mendeteksi

    bakteri yang hidup. Awalnya muncul untuk sepenuhnya menghapus sinyal dari

    bakteri yang mati keterbatasan viabilitas PCR cepat muncul dalam literatur.

    !alam penelitian ini penggunaan PMA dalam viabilitas"#PCR (v"#PCR) dinilai

    pada sel"sel $almonella enterica subsp. enterica serovar %nteritidis yang hidup dan

    mati. Protokol penanganan PMA telah dimodi&ikasi (durasi inkubasi dalam gelap

    konsentrasi PMA) untuk mengevaluasi apakah sinyal negati& lengkap dari

    $almonella mati adalah mungkin. 'amun tak satu pun dari modi&ikasi ini

    ditemukan dapat meningkatkan penghapusan sinyal #PCR yang diamati yang

    masih tersisa pada bakteri mati. Penelitian ini uga menggaris bawahi bahwa PMA

    mungkin tiba"tiba menurunkan sinyal #PCR yang diamati pada $. enteritidis

    hidup pada konsentrasi rendah. Akhirnya penggunaan sel $. enteritidis yag

    dibunuh melalui proses yang mengubah dindingmembran sel atau tidak memberi

    kita petunuk untuk menawab pertanyaan tentang non-total extinctiondari sinyal

    dari sampel sel"sel yang mati dalam v-qPCR assay. Memang data yang kuat

    mengindikasikan bahwa sinyal #PCR sisa diamati pada sel yang tidak dapat di

    kultur tidak hanya tergantung pada integritas dindingmembran sel dari bakteri.

    Menurut hasil ini penulis menyarankan bahwa untuk sistem deteksi bakteri

  • 7/26/2019 Translate Enny Evluation

    2/21

    bawaan makanan yang cepat dan handal sebuah pengayaan setelah analisis #PCR

    harus disiapkan untuk v"#PCR.

    1 Perkenalan

    Patogen bawaan makanan merupakan sebuah masalah yang penting seperti

    yang teradi di %ropa pada tahun *+,* telah dilaporkan sebanyak -,.+/ kasus

    pada manusia yang mengakibatkan 0, kematian (%1$A dan %C!C *+,/). 2ntuk

    dapat mencegah teradinya wabah tersebut bahan makanan dipantau sesuai

    dengan Peraturan 3omisi %ropa *+4*++5 di mana kriteria mikrobiologi

    diberikan untuk setiap kategori makanan (3omisi 2ni %ropa *++5). !alam

    peraturan ini metode re&erensi yang digunakan untuk mencari keberadaan

    patogen bawaan makanan sebagian besar berbasis kultur (misalnya 6$7 ,--0a

    ,--0b *++, *++* *++0a *++0b). Metode"metode konvensional ini cukup

    e&isien dan hanya mendeteksi bakteri yang hidup tetapi memakan waktu dan

    tenaga. 7leh karena itu mereka tidak cocok dalam kasus wabah dimana awaban

    yang cepat sangat diperlukan.

    Metode molekuler secara progresi& diakui sebagai alternati& yang berharga

    karena mereka cepat sensiti& dan spesi&ik. 'amun polymerase chain reaction

    (PCR) atau real"time PCR (#PCR) memperkuat !'A baik pada bakteri mati

    ataupun hidup sebagai !'A tetap stabil setelah kematian bakteri (8i dkk *+,9.

    Masters dkk ,--/9. :ol&&s dkk. *++5). !ua teknik potensial dapat digunakan

    hanya untuk mendeteksi bakteri hidup. ;ang pertama berdasarkan pada deteksi

    mR'A dengan menggunakan reverse"transcriptase (R

  • 7/26/2019 Translate Enny Evluation

    3/21

    teknik deteksi ini membutuhkan ekspresi gen yang ditargetkan yang dapat

    bervariasi dalam kondisi stres. $elanutnya R'A sangat sensiti& terhadap

    degradasi dalam matriks kompleks seperti makanan. $ecara keseluruhan

    penggunaan teknologi R

  • 7/26/2019 Translate Enny Evluation

    4/21

    menyebabkan berkurangnya kemampuan untuk mengekstrak atau memperkuat

    !'A masing"masing ($oeima dkk *++4.). 3arena PMA tidak mampu

    menembus bakteri dengan dinsing membran sel yang intak hanya !'A dari

    bakteri dengan dinding membran sel yang lemah berikatan dan dengan demikian

    tidak diperkuat oleh (#) PCR ('ocker dkk *++09. $hapiro *++).

    !e&inisi viabilitas bakteri masih menadi subyek kontroversi. ;ang

    paling umum adalah> ketika sampel dikeluaran pada media padat yang sesuai

    bakteri mati tidak dapat menghasilkan colony &orming unit (C12) sedangkan

    bakteri hidup mampu membentuk C12 (

  • 7/26/2019 Translate Enny Evluation

    5/21

    ?ach *+,9. %liza#uivel dkk *+,*a *+,*b9 Dose&sen dkk . *+,+9 3im dan 3o

    *+,*9 8iang dkk *+,,9. Mamlouk dkk *+,*9. $ingh dkk *+,9. $oeima dkk

    *+,*9. van 1rankenhuyzen dkk *+,,) hanya untuk mendeteksi bakteri hidup.

    PMA awalnya dilaporkan sepenuhnya menghapus sinyal dari bakteri mati di v"

    PCR ('ocker dkk. *++0) dan analisis v"#PCR (Dose&sen dkk. *+,+) tetapi

    kemudian beberapa kelemahan dari teknik ini dilaporkan. Memang penanganan

    PMA tidak selalu menyebabkan penghapusan lengkap dari sinyal #PCR bakteri

    mati (lihat di (1ittipaldi dkk. *+,+)). $ecara khusus penelitian terbaru

    menunukkan bahwa penanganan PMA tidak sepenuhnya menghapus sinyal dari

    bakteri mati) ukuran amplikon dari #PCR assay adalah pendek (8i dan Chen

    *+,9 8uo dkk *+,+9.. Martin dkk *+,9. $chnetzinger dkk *+,) ii) bakteri

    target pada konsentrasi tinggi (%liza#uivel dkk *+,*c9. 8i dan Chen *+,9

    Pacholewicz dkk *+,9.. Ehu dkk *+,*) iii) konsentrasi Mg*Fdalam reaksi PCR

    tidak disesuaikan ('ocker dkk. *++0) atau iv) kandungan lemak dari sampel

    makanan adalah tinggi (;ang dkk. *+,,) dan mungkin uga bervariasi sesuai

    dengan penanganan pembunuhan (3obayashi dkk *+,+9. 8iang dan 3eeley

    *+,*9. 'ocker dkk *++49. ;ang dkk *+,,).

    !alam penelitian ini optimalisasi protokol PMA (dengan variasi inkubasi

    dan durasi gelap dan konsentrasi PMA) pertama kali dinilai untuk mencapai full

    extinctionbakteri mati sinyal #PCR. $etelah itu untuk mengevaluasi angkauan

    dinamis dari v-qPCR assay diperiksa umlah yang berbeda dari $almonella

    %nteritidis hidup dan salmonella yang dibunuh dengan isopropanol. Akhirnya

    untuk lebih memahami mode dari aksi PMA sel"sel $. enteritidis dibunuh oleh

  • 7/26/2019 Translate Enny Evluation

    6/21

    proses yang berbeda yang mempengaruhi atau tidak integritas membrandinding

    sel yang bersamaan dianalisis dengan v"#PCR berdasarkan pengamatan kultur

    dan mikroskopis. Penerapan umum v"#PCR untuk sistem deteksi $. enteritidis

    uga dibahas.

    ! "a#an dan metode

    !1 "akteri strain dan kondisi pertumbu#an

    $almonella enterica enteritidis ( B6 0* dari ?elgia salmonella 'RC)

    digunakan sebagai bakteri model untuk patogen bawaan makanan =ram"negati&.

    $atu koloni tunggal yang khas diinokulasi dalam ,+ ml steril ?rain eart 6n&usion

    (?6) di vorteG dan diinkubasi pada 4HC selama sekitar ,0 am. 3ultur sepuluh

    mikroliter semalaman (7') ini diinokulasi ke dalam ,+ ml ?6 broth steril yang

    baru dan diinkubasi tanpa mengocok selama 5 sampai / am pada 4HC untuk

    mendapatkan kultur pada &ase pertumbuhan eksponensial (7! 0++ nm antara +

    dan +0) .

    !! Pen$a$a#an S enteritidis

    3onsentrasi awal $. enteritidis ditentukan dengan melakukan pengenceran

    sepuluh kali lipat ,++ Il dari pengenceran "/ sampai "4 diletakkan pada plate

    pada 'utrient Agar ('A) dan diinkubasi pada suhu 4 H C semalam. Plate dengan

    kurang dari ++ C12 dipertahankan untuk enumerasi dan perhitungan umlah

    bakteri awal dinyatakan sebagai colony &orming units ml (C12 ml).

  • 7/26/2019 Translate Enny Evluation

    7/21

    !% &ontrol kematian

    Proses pembunuhan digunakan pada $. enteritidis yang hidup dievaluasi

    dengan meng"enumerasi sel yang sedang tumbuh dengan meletakkan ,++ ml

    sampelpadai plate 'A dan di inkubasi selama */ am pada suhu 4 H C.

    !' Penanganan PMA

    $ampel seratus mikroliter yang diui dipindahkan pada tabung %ppendor&

    ,.5ml. !i ruangan gelap (PMA sensiti& terhadap cahaya) 45 IM atau ,5+ IM dari

    PMA *+ mM (?iotium> ?

  • 7/26/2019 Translate Enny Evluation

    8/21

  • 7/26/2019 Translate Enny Evluation

    9/21

    analisis pencairan suhu produk ampli&ikasi dilakukan secara bertahap dengan

    meningkatkan suhu dari 0+ H C hingga -5 H C selama *+ menit ( +0 H C *+

    detik). 3ontrol positi& menggunakan g!'A dari $. enteritidis pada ,+/kopi dan

    kontrol negati& menggunakan !'Ase dan R'ase &ree water (Acros =eel ?elgia)

    yang termasuk dalam setiap reaksi #PCR.

    !* Analisis data

    !*1 S+"R,reen qPCR assay

    2ntuk interpretasi $;?RO=reen #PCR assay dua kriteria yang

    dipertimbangkan> nilai siklus kuanti&ikasi (C#) dan suhu leleh dari amplikon

    (

  • 7/26/2019 Translate Enny Evluation

    10/21

    antara kondisi yang dihitung dan sesuai dengan P"value mereka dikoreksi untuk

    hipotesis simultan yang mengui kesesuaian dengan koreksi $idak. Perbedaan

    dengan P value S ++5 dianggap berbeda secara statistik.

    !/ Alat analisis 0iabilitas bakteriLive / Dead BacLight

    !alam rangka untuk membedakan bakteri mikroskop dengan

    dindingmembran sel yang lemah (mati) dari orang"orang dengan

    dindingmembran sel non"lemah (hidup) alat analisis viabilitas bakteri 86B%

    !%A!O ?ac8ight (84++4 probe Molekuler) digunakan sesuai dengan

    rekomendasi pabrikan. alat ini menyediakan ui &luoresensi dua warna> $ytoO-

    pewarnaan asam nukleat &luorescent hiau (/@+5++ nm) dan propidium yodium

    (P6) pewarnaan asam nukleat &luorescent merah (/-+05 nm). $ytoO- dapat

    mewarnai semua bakteri dalam suatu populasi sedangkan P6 hanya menembus

    dinding membran sel bakteri yang lemah dan menyebabkan pengurangan pada

    pewarnaan &luoresensi $;

  • 7/26/2019 Translate Enny Evluation

    11/21

    secara menyeluruh dan diinkubasi pada suhu kamar selama ,5 menit dalam gelap.

    $eratus mikroliter agarose *K dalam air &isiologis ditambahkan ke setiap sampel

    (akhir konsentrasi ,K agarose).

  • 7/26/2019 Translate Enny Evluation

    12/21

    positi& dan negati& masing"masing memberi hasil positi& dan negati& yang

    diharapkan. 2ntuk sampel mati salah satu proses pembunuhan yang paling

    umum isopropanol 4+K digunakan untuk menghilangkan bakteri. 3ematian

    diperiksa di plate dan sekitar 4 C12 ml (pengulangan pertama) dan + C12 ml

    (pengulangan kedua) $. enteritidis ditemukan setelah pemberian isopropanol.

    $eperti yang ditunukkan pada =ambar. ,A tidak ada e&ek pemberian

    PMA yang diamati pada $. enteritidis yang hidup untuk kedua kali inkubasi gelap

    karena pengurangan sinyal rata"rata mereka (QC#) tidak berbeda secara

    signi&ikan. Duga seperti yang diharapkan pemberian PMA meginduksi penurunan

    sinyal #PCR yang signi&ikan (P ++++,) pada $. enteritidis yang dibunuh dengan

    isopropanol. 'amun tidak ada perbedaan signi&ikan yang diamati antara menit ke

    5 dan 0+ menit inkubasi gelap (P +@5). Penurunan C# rata adalah ca. / untuk

    kedua periode inkubasi. 7leh karena itu peningkatan waktu inkubasi 5 sampai 0+

    menit tidak memiliki e&ek yang signi&ikan pada QC# $. enteritidis mati yang

    diberikan PMA dan dengan demikian tidak dapat digunakan untuk memperbaiki

    protokol.

    %1! Pengaru# konsentrasi PMA pada pengurangan sinyal qPCR

    2ntuk menyelidiki apakah konsentrasi PMA memiliki e&ek pada

    pengurangan sinyal #PCR terkait dengan $. enteritidis mati + 45 dan ,5+ IM

    PMA dibandingkan (5 menit inkubasi gelap digunakan untuk semua konsentrasi

    PMA). $ebuah rentang dinamis kultur $. enteritidis dari digunakan sepuluh kali

    lipat pengenceran 4- sampai - log C12 ml (40 J ,+4 C12 ml menadi 40 J

    ,+ C12 ml). Pembunuhan dilakukan dengan isopropanol 4+K. %&isiensi

  • 7/26/2019 Translate Enny Evluation

    13/21

    prosedur pembunuhan telah diveri&ikasi untuk setiap pengenceran $. enteritidis

    oleh tidak adanya pertumbuhan pada agar nutrien. C#"value sampel mati yang

    tidak ditangani dengan PMA (+ IM) dibandingkan dengan 45 dan ,5+ IM

    (=ambar. ,?). kontrol #PCR positi& dan negati& masing"masing memberi hasil

    positi& dan negati& yang diharapkan.

    $eperti yang diharapkan C#"value yang lebih tinggi diamati dengan

    perlakuan PMA (QC# ca. 4) dibandingkan tanpa perlakuan PMA (+ M). 'amun

    untuk semua pengenceran yang diui C#"value" yang didapatkan dengan 45 dan

    ,5+ TM PMA tidak berbeda secara signi&ikan. Menariknya pengamatan ini

    menunukkan bahwa peningkatan konsentrasi PMA tidak mengurangi sinyal

    #PCR sampel $. enteritidis mati.

    ambar 1. Pengaruh waktu inkubasi gelap dan konsentrasi PMA pada kultur

    yang $. enteritidis hidup dan mati. A. ?oGplot dari periode PMA inkubasi yang

    berbeda (5 dan 0+ menit) pada bakteri hidup (n 0) dan mati (n 0) pada @4 log

    C12 ml. !elta C#> pengurangan sinyal #PCR antara sampel yang diperlakukan

    dan tidak diperlukan dengan PMA 45 pM huru& yang berbeda menunukkan nilai

    yang berbeda secara signi&ikan pada P U ++5. ?. Pengaruh tiga konsentrasi PMA

    (+ 45 dan ,5+ IM) pada lima suspensi yang berbeda dari sel"sel mati> 4.- 0.-

    5.- /.- dan .- C12 ml (n ,).

    %! E.ek PMA pada konsentrasi S enteritidis yang berbeda

    2ntuk menilai apakah umlah bakteri dalam sampel dapat berdampak pada

    pengurangan sinyal v"#PCR bakteri mati empat konsentrasi $. enteritidis

    digunakan> 4 /@ 0@ dan @@ log C12 ml. $etiap sampel diui dalam rangkap

  • 7/26/2019 Translate Enny Evluation

    14/21

    tiga dan #PCR dilakukan dua kali pada setiap ulangan. 3ontrol #PCR positi& dan

    negati& masing"masing memberi hasil positi& dan negati& yang diharapkan. $.

    %nteritidis hidup dan dibunuh dengan isopropanol 4+K diui. %&isiensi prosedur

    pembunuhan telah diveri&ikasi oleh tidak adanya koloni di plate untuk semua

    konsentrasi $. enteritidis yang diui. C#"value yang diperoleh dengan masing"

    masing enis sampel dicatat (=br. *).

    Percobaan ini memberikan tiga hasil yang berbeda. Pertama C#"value

    yang diperoleh dengan sampel hidup dan mati yang tidak diperlakukan dengan

    PMA menyaikan pergeseran signi&ikan tak terduga antara , dan / C# untuk

    empat konsentrasi sel yang diui. al ini menggambarkan bahwa kematian itu

    sendiri sudah menginduksi penurunan sinyal #PCR yang mungkin disebabkan

    oleh hilangnya !'A yang teradi pada langkah panen sel dari sel"sel mati

    dengan dinding membran sel yang sangat rusak. 3edua untuk $. enteritidis mati

    seperti yang diharapkan C#"value yang diamati dengan sampel PMA treatment

    secara signi&ikan lebih tinggi dibandingkan dengan sampel non PMA treatment

    untuk semua konsentrasi yang diteliti (=ambar *>. @.@! 0.@! /.@! dan .4! ).

    Pergeseran diamati secara signi&ikan lebih tinggi untuk @@ log C12 ml dengan

    ca. QC# /5 sedangkan pergeseran sama untuk konsentrasi lainnya dengan QC#

    antara *4 dan -. asil ini mengkon&irmasi e&ek PMA pada sampel mati tetapi

    uga menunukkan lagi bahwa PMA tidak dapat benar"benar menghapus sinyal

    dari sel"sel mati pada semua konsentrasi yang diteliti. 3etiga seperti yang

    ditunukkan sebelumnya pada sampel hidup (@.@A dan 0.@A) pada konsentrasi

    tinggi (@@ dan 0@ log C12 ml) PMA treatment tidak berpengaruh pada

  • 7/26/2019 Translate Enny Evluation

    15/21

    pengurangan sinyal karena tidak ada perbedaan signi&ikan yang diamati antara

    C#"value yang diperoleh pada sel hidup (=ambar *>. @.@A dan 0.@A) dengan PMA

    treatment atau tidak. $ebaliknya pada konsentrasi rendah (4 dan /@ log C12

    ml) PMA memiliki e&ek yang signi&ikan pada sel yang hidup. Memang C#"value

    yang diperoleh dengan sampel hidup dengan PMA treatment secara signi&ikan

    lebih tinggi dengan pergeseran antara , dan *0 C# dibandingkan sampel hidup

    non PMA treatment (=ambar *>. /.@a dan .4A). Penurunan sinyal dari sel"sel

    hidup pada konsentrasi rendah dapat menyebabkan underestimasi bakteri hidup

    dan dalam skenario kasus terburuk dapat menyebabkan negati& palsu dengan

    umlah yang sangat rendah bakteri hidup. Penurunan sinyal sel yang hidup ini

    sebelumnya diamati padaLegionellaspp. (;anez dkk. *+,,) danEscherichia coli

    (8iu dan Mustapha *+,/).

    ambar *. Pengaruh PMA pada C#"value konsentrasi yang berbeda dari

    $.%nteritidis hidup dan mati (n ) .:> tanpa PMA P> dengan PMA 45 IM B>

    hidup !> mati. Angka @@ 0@ /@ dan 4 menunukkan konsentrasi sel dalam

    log C12 ml. huru& yang berbeda menunukkan nilai yang berbeda secara

    signi&ikan pada P U ++5

    %% Pengaru# proses pembunu#an yang berbeda ter#adap respon v-qPCR

    2ntuk lebih memahami mengapa PMA treatment tidak benar"benar

    menghapus sinyal #PCR $. enteritidis mati (antara 4- dan ,, log C12 ml)

    empat proses pembunuhan atau stres proses yang berbeda (panas isopropanol

    antibiotik atau pembekuan) dianalisis menggunakan tiga protokol evaluai

  • 7/26/2019 Translate Enny Evluation

    16/21

    viabilitas yang berbeda > i) sampel yang di letakan pada plate agar nutrien (teknik

    mikrobiologi konvensional) ii) sampel dianalisis dengan v"#PCR (teknik

    molekuler) dengan 45 pM PMA dan 0+ menit inkubasi gelap dan iii) sampel

    dicelup dengan 8ive !eadO ?ac8ight bakterial Biability kit dan diamati

    dengan mikroskop (teknik mikroskopis). %mpat proses pembunuhan atau stres

    yang berbeda dipilih untuk bertindak berbeda pada integritas dinding membran

    sel. Alkohol (seperti isopropanol) membuat bakteri dehidrasi mengganggu

    dindingmembran sel dan menyebabkan koagulasi protein. Panas membuat

    denaturasi protein dari dinding dan membran sel &os&olipid menadi lebih cair

    menyebabkan gangguan integritas dinding dan membran sel. ?entuk beku kristal

    es di dalam bakteri yang dapat membuat ruptur dindingmembran sel. $ampel

    yang dibunuh dengan isopropanol panas dan beku dapat menyebabkan persentase

    yang tinggi dari bakteri mati dengan dindingmembran sel yang terganggu.

    3anamisin memiliki mode aksi yang berbeda. !engan berinteraksi dengan subunit

    +$ dari ribosom ini akan menginduksi mistranslasi dan secara tidak langsung

    menghambat sintesis protein (Misumi dan 'ocker dan Camper *++-).

    !ibandingkan dengan eksperimen kontrol menggunakan bakteri hidup v"

    #PCR penurunan sinyal signi&ikan bakteri mati (antara *5 sampai /5 C#) pada

    sampel bakteri (n -) yang dibunuh dengan empat proses yang berbeda (=ambar.

    ).

  • 7/26/2019 Translate Enny Evluation

    17/21

    positi& dan negati& masing"masing memberi hasil positi& dan negati& yang

    diharapkan.

    2ntuk menyelidiki lebih lanut data ini dalam kaitannya dengan integritas

    membran dinding sel hasil v"#PCR dibandingkan dengan umlah plate dan 8ive

    dead alat pengamatan mikroskopis (

  • 7/26/2019 Translate Enny Evluation

    18/21

    .). Pengamatan ini menunukkan bahwa hasil v"#PCR tidak ketat berkorelasi

    dengan status &isik dari dindingmembran sel bakteri.

    ' &esimpulan

    3arena deteksi cepat patogen bawaan makanan masih menadi tantangan

    perbaikan metode yang tersedia saat ini dan yang diterima secara internasional

    masih diperlukan. 6$7

  • 7/26/2019 Translate Enny Evluation

    19/21

    dalam percobaan yang berbeda dilaporkan dalam penelitian ini. 6nkubasi gelap

    yang lebih panang atau konsentrasi yang lebih tinggi dari PMA mengakibatkan

    peningkatan yang signi&ikan dari penurunan sinyal. Penelitian lain menelaskan

    kemungkinan perbaikan dari v"#PCR dengan mengganggu lebih lanut dari

    dindingmembran sel S enterica! LmonocytogenesdanE colimati sebelum PMA

    treatment ('kuipou"3en&ack dkk *+,9. :ang dkk . *+,/a *+,/b9. ;ang dkk

    *+,, *+,/). !alam makalah ini bahkan ika pengurangan sinyal lebih baik

    sinyal masih diamati pada bakteri mati. al ini dapat menyebabkan overestimasi

    dari keberadaan bakteri hidup dalam sampel dan sinyal positi& palsu dengan

    bakteri mati. 6ni bukan masalah besar untuk tuuan deteksi karena bakteri yang

    terdeteksi harus selalu dikon&irmasi oleh isolasi bakteri.

    Penelitian kami uga menggaris bawahi bahwa PMA dapat mengurangi

    sinyal bakteri hidup pada konsentrasi rendah dan mengkon&irmasi penelitian

    terakhir lainnya (8iu dan Mustapha *+,/9. ;anez dkk *+,,). 6ni

    merepresentasikan risiko dari hasil negati& palsu ika sinyal turun di bawah 87!

    dari #PCR assay. 'egati& palsu ini tidak dapat diterima dalam sistem deteksi

    patogen bawaan makanan di mana toleransi kosong adalah aturan seperti halnya

    untuk $. enteritidis (3omisi 2ni %ropa *++5 *+,).

    Percobaan terakhir yang dilakukan pada $. enteritidis yang dibunuh oleh

    proses yang mengubah atau tidak dindingmembran sel memberi beberapa

    petunuk untuk pertanyaan tentang non-total extinctionsinyal sampel mati di v"

    #PCR assay. Memang sebagian dari bakteri yang tidak dapat di kultur

    (diharapkan akan mati) memiliki membran dinding sel yang utuh. 3arena PMA

  • 7/26/2019 Translate Enny Evluation

    20/21

    mampu menembus hanya bakteri dengan dindingmembran sel yang lemah di v"

    #PCR assay bakteri mati dengan membran dinding sel utuh harus memberikan

    sinyal yang mirip dengan bakteri hidup. 'amun sampel yang diberikan kanamisin

    mengangkat inkoherensi tentang modus tindakan dari v"#PCR. Memang enis

    sampel yang dilemahkan ini menampilkan persentase yang tinggi dari bakteri

    yang tidak dapat di kultur dengan dindingmembran sel yang utuh meskipun

    mereka tiba"tiba memberi salah satu QC# terbaik di v"#PCR. asil ini

    menggambarkan bahwa hasil v"#PCR tidak hanya berdasarkan pada integritas

    dinding membran sel bakteri.

    2ntuk menyimpulkan menurut hasil penelitian ini dan dari tinauan yang

    terbaru (1ittipaldi dkk. *+,*) untuk sistem deteksi patogen bawaan makanan

    #PCR tidak dianurkan untuk mengganti langkah pengayaan dengan PMA

    treatment dalam bentuk yang sekarang . Pada tahap ini pengetahuan saat ini pada

    sistem deteksi bakteri patogen bawaan makanan penggunaan pengayaan sebelum

    analisis #PCR diikuti oleh kon&irmasi hasil positi& dengan metode berbasis kultur

    masih menadi pendekatan yang paling tepat.

    ambar. . ?oGplot dari pengaruh PMA 45 pM pada pengurangan sinyal #PCR

    sel $. enteritidis yang diberikan dengan isopropanol panas kanamisin atau

    pembekuan (n -). V

  • 7/26/2019 Translate Enny Evluation

    21/21

    3$apan 4erima &asi#

    Penelitian ini didanai oleh hibah ;lie&& dari 8ayanan 2mum 1ederal ?elgia>

    Rantai Makanan 3eselamatan dan 8ingkungan 3esehatan Masyarakat.